Подсчитано, что для того, чтобы секвенирование (определение последовательности нуклеотидов) генома человека с медицинскими целями было рентабельным, необходимо, чтобы стоимость такой процедуры не превышала $1000. Именно это число стало целью, к которой стремятся разработчики и производители приборов для широкомасштабного секвенирования ДНК. Еще один вариант прибора для проведения недорогого секвенирования генома человека был предложен недавно компанией Лайф Текнолоджис (Life Technologies).

В новом приборе, названном Ion Torrent (что в переводе с английского означает «ионный поток»), используется полупроводниковая технология. Для проведения анализа применяют специальные чипы, на поверхность которых нанесены микролунки. В микролунках происходит синтез новых нитей ДНК на имеющихся матрицах (в каждой микролунке расположена одна матрица ДНК). При добавлении к растущей нити ДНК каждого нового нуклеотида происходит высвобождение протона, т.е., изменяется значение pH реакционной среды. Это изменение pH фиксируется с помощью специальных сенсоров, расположенных во внутреннем слое чипа. Полученная информация обрабатывается специализированным программным обеспечением, которое выдает результат: ­ последовательность секвенируемых фрагментов ДНК. Более подробную информацию о технологии можно найти на сайте www.iontorrent.com

По заверению компании, прибор будет способен обеспечить секвенирование генома человека за $1000 в течение всего нескольких часов (например, в течение примерно 2 часов, если секвенировать не весь геном целиком, а только экзоны генов). В данную сумму входит стоимость расходных материалов и реактивов, необходимых для подготовки матрицы (ДНК), амплификации (синтеза новой нити ДНК на матрице) и секвенирования, а также стоимость используемых в приборе чипов. Прогнозируется, что стоимость самого прибора составит $149 000, а сопутствующих ему приспособлений – еще $95 000. Коммерческий выпуск приборов запланирован на 2012 год.

(перевод с русского на английский / English to Russian Translation) 

http://www.biotechniques.com/news/biotechniquesNews/biotechniques-325697.html